Бекасов Л.С., Буканов Ф.Ф., Салимов Ш.Р.
МЕТОД НЕПОСРЕДСТВЕННОЙ ФОРМАЛЬНОЙ ОЦЕНКИ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ТЕКСТОВ
Самарский Госудаственный Технологический Университет
Ниже приводится метод формального представления регуляторов простейших бактерий, основанной на применении теоретических основ нелинейного спектрального анализа, с применением среды “Mathcad”, для реализации специфичных условий, позволяющих осуществить сжатие данных.
Ключевые слова: Генетический текст, GATC элементы, формализация дискретных данных, Mathcad.
The following is a method of formal representations of simple controls bacteria, based on the use of the theoretical foundations of nonlinear spectral analysis, using the environment "Mathcad", for the implementation of specific conditions, allows data compression.
Key words: genetic text, GATC elements, the formalization of discrete data, Mathcad.
В литературе с целью формального представления генетических текстов любого типа используются, как правило, статические методы, основанные на таких критериях, как частота встречаемости, математическое ожидание или дисперсия, реже моменты более высоких порядков[1,2]. Однако, использование методов, широко описанных в литературных источниках, не позволяют выявить функциональные особенности, обусловленные структурным расположением самих элементов.
Для формального описания генетических цепочек важным является представление GATC (гуанин, аденин, тимин, цитозин) элементов числовыми эквивалентами. Наиболее простым способом решением этого вопроса можно обеспечить, используя такой критерий, как молеклярная масса каждого компонента, в частности: G=150,14; A=134,14; T=125,12; C=110,11.